土壤中藻类大多属蓝绿藻、硅藻、绿藻。藻类的个体有单细胞,也有呈丝状的多细胞,由于它们聚在一起可以形成很大群体,以致肉眼也容易看见。藻类含有叶绿素,能利用光能将CO2合成有机质。不少蓝藻能够固定空气中的游离氮素,在积水的水面和水稻田中常用大量的藻类发育,为土壤积累有机物质。